中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學論文特征分析

導語：中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學論文特征分析一文來源于網(wǎng)友上傳，不代表本站觀點，若需要原創(chuàng)文章可咨詢客服老師，歡迎參考。

網(wǎng)絡藥理學（Networkpharmacology）一詞于2007年由英國鄧迪大學AndrewLHopkins首次提出，并于2008年進行了具體闡釋——指運用網(wǎng)絡方法分析藥物與疾病之間的“多成分、多靶點、多途徑”的協(xié)同作用關系的藥理學分支學科[1-2]。其對于“疾病-基因-靶點-藥物”相互作用的網(wǎng)絡分析方法，為中醫(yī)藥的現(xiàn)代研究與發(fā)展提供了新的思路與途徑。成分的復雜性、方劑配伍的多樣性、辨證論治的差異性，使中醫(yī)藥的現(xiàn)代化受到了一定限制。網(wǎng)絡藥理學的引入、應用與發(fā)展，可助推中醫(yī)藥的現(xiàn)代化進程。自2010年，應用網(wǎng)絡藥理學方法分析中醫(yī)藥的文章發(fā)表數(shù)量逐年增多，對此，我們希望從文獻的角度對已發(fā)表的文章進行統(tǒng)計分析，了解網(wǎng)絡藥理學在中醫(yī)藥研究領域的應用現(xiàn)狀。本文采用文獻計量學方法[3]，即綜合運用文獻學、統(tǒng)計學、數(shù)學來定量分析一切知識載體的方法，對PubMed、WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫中應用網(wǎng)絡藥理學方法研究中醫(yī)藥相關問題的文獻進行統(tǒng)計，重點分析作者單位分布、研究內(nèi)容、來源期刊以及所引參考文獻等，評價目前國內(nèi)外中醫(yī)網(wǎng)絡藥理學的科研水平，總結研究熱點，分析研究趨勢，為學者今后的研究提供方向。

1材料與方法

1.1納入標準與排除標準。1.1.1納入標準。運用網(wǎng)絡藥理學研究中醫(yī)藥的內(nèi)容，如復方、中藥、中藥成分、證等，均可被納入。文獻檢索的年份設定在2008—2018年。語言不設限定。1.1.2排除標準①研究方法未涉及網(wǎng)絡藥理學內(nèi)容，而僅提到“網(wǎng)絡藥理學”；②研究內(nèi)容未涉及中醫(yī)藥（含少數(shù)民族醫(yī)藥）領域相關問題，如：現(xiàn)代化學藥品、合成藥、植物藥、外國藥物等，或僅提到“中醫(yī)藥”“中醫(yī)”；③僅做綜述，meta-analysis，論述，社論；④數(shù)據(jù)庫平臺建設等。1.2資料來源與文獻篩選。文獻檢索范圍為PubMed與WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫，以“networkpharmacology”作為主題詞進行檢索，納入包含主題詞為“TCM”或“traditionalChinesemedicine”或“Chineseherbs”并且發(fā)表年份在2008—2018年，檢索式為：（（networkpharmacology）AND（traditionalChinesemedicineorTCMorChineseherbs））AND（"2007"[Date-Publication]："2018"[Date-Publication]）。文獻檢索由2位研究者同時獨立進行，閱讀所獲文獻題錄和摘要，去除重復題錄和排除明顯不符合納入標準的文獻。之后，下載所有文獻的原文，進行一一核實，并交叉核對所納入的文獻。對有分歧而難以確定的，由小組成員共同研究、討論，或由第3位研究者決定。1.3分析方法所有相關信息均納入Excel，進行頻數(shù)統(tǒng)計與分析。數(shù)據(jù)采用SPSS.20進行描述性分析。

2結果

2.1檢索結果。根據(jù)上述檢索策略，我們在PubMed和WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫分別檢索到與中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學相關文獻717和374篇。導出題錄與摘要，剔除重復文獻，共獲得原始題錄844篇。根據(jù)上述納入、排除標準，由兩名研究者分別對題錄與摘要進行初步篩選，初步納入文獻316篇，待核實文獻273篇。之后，下載所有原文，進行再次復核，納入文獻112篇，最后由小組成員共同商議或第3位研究者決定，納入19篇。最終，納入447篇全文文獻進行統(tǒng)計分析。2.2發(fā)表年份與數(shù)量。按照納入標準，中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學的文章于2008年開始發(fā)表，但數(shù)量較少，僅有2篇[4-5]，但真正介紹中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學的文章，則由中國第二軍醫(yī)大學張衛(wèi)東教授團隊在2009年發(fā)表[6]。在隨后的4年里，這方面的文章亦不是很多，從2013年開始逐漸增多，而增幅最大的當屬2017、2018兩年，尤其是2018年，有關中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學文章的發(fā)表首次突破100篇。見圖1。2.3發(fā)表地區(qū)分布情況。2.3.1第一作者所屬單位分布情況。據(jù)統(tǒng)計，以第一作者單位發(fā)表，分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計487篇次（注：某些第一作者單位不唯一，統(tǒng)計時分別計算；下同），其中北京占有132篇次，達27.10%。筆者對國內(nèi)前10名第一作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進行了統(tǒng)計，結果見表1。同時，我們進一步細分了第一作者單位在北京的分布情況，發(fā)現(xiàn)前5位的機構分別是中國中醫(yī)科學院（55篇）、北京中醫(yī)藥大學（34篇）、中國醫(yī)學科學院（11篇）、清華大學（9篇）及中國人民解放軍第302醫(yī)院（7篇）。再者，我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)第一作者單位隸屬國外，分別來自于美國（4篇）、德國（2篇）和韓國（1篇）及澳大利亞（1篇）。2.3.2共同第一作者所屬單位分布情況。所納入的文獻中，173篇含有共同第一作者，其所在單位分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計188篇次，其中北京55篇次，達29.26%。同時，我們對國內(nèi)前10名共同第一作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進行了統(tǒng)計，結果見表1。統(tǒng)計時，我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)共同第一作者單位隸屬國外，分別來自于美國（5篇）、德國（1篇）、韓國（1篇）、埃及（1篇）及澳大利亞（1篇）。2.3.3通訊作者所屬單位分布情況。在447篇納入的文獻中，均有通信作者，以通信作者單位發(fā)表，分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計444篇次，其中北京123篇次，達27.70%。同時，我們對國內(nèi)前10名通信作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進行了統(tǒng)計，結果見表1。再者，我們進一步細分了通信作者單位在北京的分布情況，發(fā)現(xiàn)前5位的機構分別是中國中醫(yī)科學院（47篇）、北京中醫(yī)藥大學（30篇）、中國醫(yī)學科學院（12篇）、中國人民解放軍第302醫(yī)院（10篇）、北京大學（9篇）及清華大學（9篇）。與此同時，我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)通信作者單位隸屬國外，分別來自于美國（4篇）、德國（2篇）、巴基斯坦（2篇），埃及（2篇），韓國（1篇）及澳大利亞（1篇）。2.3.4共同通信作者所屬單位分布情況。所納入的文獻中，214篇含有共同通信作者，其所在單位分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計262篇次，其中北京81篇次，達30.92%。同時，我們對國內(nèi)前10名共同通信作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進行了統(tǒng)計，結果見表1。再者，統(tǒng)計時，我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)共同通信作者單位隸屬國外，分別來自于美國（8篇）和韓國（1篇）。2.3.5跨國合作情況。在所納入的文獻中，我們發(fā)現(xiàn)與國外合作的有9篇（分別來自于美國3篇、巴基斯坦2篇、埃及2篇、以色列1篇、澳大利亞1篇），此外，有2篇完全來自于德國，1篇來自于韓國，還有1篇由美國與韓國合作。2.4研究內(nèi)容。2.4.1研究載體。自從HopkinsAL于2007年10月份在NatureBiotechnology發(fā)文初步論述其對網(wǎng)絡藥理學的認識之后，2008年就有有關中醫(yī)網(wǎng)絡藥理學的文章發(fā)表，經(jīng)過10余年的發(fā)展，有關中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學的發(fā)文數(shù)量呈逐年上升趨勢，增幅較大的發(fā)生在2017、2018年，所涉及的研究載體包括中藥復方、數(shù)味中藥（注：文中未提及具體方劑，又不屬于配伍或藥對的2味及2味以上的藥物組合）、配伍、單味藥、中藥成分及證候研究。其中，中藥復方類研究最多（223篇次），其次為中藥成分，單味藥及數(shù)味中藥次之，緊接其后的是配伍，而具有中醫(yī)特色的證的研究論文最少。結果見表2。再者，我們對中藥復方類進行了細分，發(fā)現(xiàn)自擬方占據(jù)復方類研究的一半之多（130/223），時方與經(jīng)方（注：限定為張仲景《傷寒雜病論》中所載方劑），分別為49和40篇次。因有5篇文章，存在經(jīng)方、時方、自擬方2種及2種以上的混合研究，故在統(tǒng)計時，采取重復計算。2.4.2研究方向。在納入的447篇文獻中，所涉及的研究方向包括藥物作用機制、分子機制、炮制、中醫(yī)四氣、藥物毒理、臟器毒理、氣與血的分子機制、證及疾病機制等，共計481篇次。若以世界衛(wèi)生組織頒布的ICD-11疾病系統(tǒng)分類[7]，則共計423篇次（含傳統(tǒng)醫(yī)學病證7篇次），排名前5位的分別是循環(huán)系統(tǒng)疾病（85篇次）、腫瘤（76篇次）、消化系統(tǒng)疾病（63篇次）、神經(jīng)系統(tǒng)疾病（55篇次）以及肌肉骨骼系統(tǒng)或結締組織疾病（32篇次）。對腫瘤進一步細分，發(fā)現(xiàn)運用中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學研究乳腺癌、結直腸癌及肝癌的較多，分別為11、10及7篇次。2.5.3論文提出預測后的驗證情況。通過網(wǎng)絡藥理學，對數(shù)據(jù)進行挖掘，這是一種預測，其對預測結果正確與否，需要進一步的驗證。在447篇文獻中，有166篇文章進行了驗證（注：文獻驗證、分子對接仿真實驗等驗證方式，并未計算在內(nèi)）。從表3可以看出，在2013年以前，中醫(yī)網(wǎng)絡藥理學對預測結果驗證較少，累計不足驗證文獻的10%，而從2015年開始，預測結果的驗證比例上升趨勢很明顯，尤其是2018年一年，其驗證文獻占全部驗證文獻的近1/3。再者，在166篇驗證的文獻中，13篇文獻發(fā)表于非SCI期刊，內(nèi)含2篇以中文發(fā)表的國內(nèi)期刊，剩余153篇，均發(fā)表于SCI期刊。2.5期刊分布。所納入文獻，共發(fā)表于105種期刊，中文刊僅有4種，分別為中國中藥雜志（45篇）、藥學學報（7篇）、中國中西醫(yī)結合雜志（1篇）、中南大學學報（醫(yī)學版）（1篇），合計發(fā)表54篇，占12.08%（54/447）。在剩余的101中英文期刊中，據(jù)2018年JCR引證報告，除AfricanJournalofTraditional，ComplementaryandAlternativeMedicines（未被納入），BiomedicalReports（未被納入），ChineseScienceBulletin（未被納入），CellularPhysiologyandBiochemistry（被剔除），Oncotarget（被剔除）和TumorBiology（被剔除）外，其余95種刊物，均為SCI。2.6參考文獻引用情況。普賴斯指數(shù)是指近5年文獻占所引文獻中的比例，它可以從側(cè)面反映出期刊所載論文（引文）的新穎性和使用壽命，是一種衰減系數(shù)[8]。普賴斯指數(shù)越大，文獻越新穎，其老化的速度也越快。在納入的文獻中，我們根據(jù)語種不同，統(tǒng)計了文獻不同年份所引用的文獻總數(shù)、相對近5年文獻引用數(shù)、平均引用文獻數(shù)及普賴斯指數(shù)，見表6。

3討論

“網(wǎng)絡藥理學”從提出至今也有13年，當初Hopkins意識到“一藥一靶一病”的不足，結合先前的系統(tǒng)生物學和多向藥理學，通過對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡分析，他指出多成分、多靶點藥物對復雜疾病起到了很好的治療效果。網(wǎng)絡藥理學的系統(tǒng)性和整體性思維模式與中醫(yī)藥理論不謀而合，其已成為當前中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究的新的技術手段[9]，為此梳理十余年的中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學的現(xiàn)狀對當下熱點和今后的發(fā)展趨勢進行判斷很有必要。趙芳卿等[10]選用WebofScienceTM核心合集數(shù)據(jù)庫（包括SCI-Expanded、CCR-Expanded、IC）作為來源數(shù)據(jù)庫，以networkpharmacology，polypharmacology等關鍵詞進行檢索，采用多元統(tǒng)計分析方法，對文獻發(fā)表時間、國家等外部特征進行分析，得出發(fā)文量前4位，分別是美國、中國、德國和英國。而本文在networkpharmacology前限定了“中醫(yī)藥”，則發(fā)文量以中國為第一，遠超美國等其他國家，但結合所發(fā)文章所在期刊的影響因子，可以發(fā)現(xiàn)，高影響力期刊很少，多數(shù)集中在4分及以下，說明對中醫(yī)藥這一具有民族特色的醫(yī)學，我們要進行深入研究，以便更好的向世界傳播。就中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學的研究載體而言，經(jīng)統(tǒng)計發(fā)現(xiàn)，復方研究的仍占多數(shù)（223/454），若將配伍和數(shù)味中藥也算作復方，則占據(jù)整個研究內(nèi)容篇次近62%。由此，也可以說明中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學符合中醫(yī)整體觀和辨證論治的思維模式，在研究中藥復方方面具有獨特優(yōu)勢，通過構建“藥物-基因-疾病”網(wǎng)絡和利用高通量分析檢測等技術，挖掘中藥復方有效活性成分及多成分間的協(xié)同作用，預測中藥復方有效成分靶點，富集關鍵通路，從而闡釋復方的可能作用機理。若配合模型、動物、細胞、臨床等方面的進一步驗證，其多途徑的系統(tǒng)調(diào)控機制將會得到進一步證實，從而為臨床多分子、多靶點中藥新藥研發(fā)奠定基礎。就論文提出預測后的驗證情況而言，與張弛等[11]對萬方數(shù)據(jù)庫2011—2019年中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學論文分析所得的結論不同，2015年有驗證的文章占整個11.1%，從2016—2018年，有驗證的文章比例逐漸降低；我們所得結論是從2015年開始，有驗證的文章占所有驗證文章的比例逐年升高，至2018年達到31.33%，很明顯發(fā)表于SCI期刊的文章質(zhì)量要遠遠高于國內(nèi)期刊，這值得我們深思。從期刊的影響因子、篇平均引用數(shù)及普賴斯指數(shù)來看，有關中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學高影響因子的文章較少，研究者最喜歡發(fā)表的SCI期刊分別是ScientificReports，F(xiàn)rontiersinPharmacology和JournalofEthnopharmacology。在統(tǒng)計分析所引用的參考文獻時，我們以中文和英文期刊作為群組劃分，發(fā)現(xiàn)英文期刊的篇平均引用參考文獻數(shù)明顯高于中文期刊（P<0.001），差異具有統(tǒng)計學意義；但普賴斯指數(shù)比較，則差別不大。英文刊中，去除2008—2009年的發(fā)文數(shù)少的偏差，則總體普賴斯指數(shù)處于上升，但與各學科的普賴斯指數(shù)平均值大約為50%仍有差距[12]，其文獻新穎性有待進一步加強。而中文刊，從統(tǒng)計來看，波動較大，有待進一步深入研究。

作者:倪勝樓 方明 趙笑芃 潘映辛 吳雨婷 劉芳廷 李玲孺 吳鳳芝 單位:1.北京中醫(yī)藥大學 2.遼寧中醫(yī)藥大學